La technologie révolutionnaire accélérera l’utilité de la
cartographie génétique, la découverte de biomarqueurs, le profilage des
tumeurs et l’analyse des biopsies liquides
ANN ARBOR, Michigan–(BUSINESS WIRE)–Swift Biosciences, un fournisseur de premier plan en matière de
solutions innovantes pour la préparation de librairies destinées au
séquençage génomique, a annoncé aujourd’hui le lancement des Adaptateurs
Indexés Accel-NGS® 2S, un nouveau portefeuille d’indices
qui améliore considérablement le séquençage multiplexé, de nouvelle
génération, sur les plateformes Illumina®. Cet ensemble
unique d’indices offre le plus grand ensemble d’indices simples
disponibles sur le marché pour les applications de séquençage génomique
à haut débit, permettant aux utilisateurs de multiplexer en toute
confiance jusqu’à 96 échantillons indexés en mode simple et
768 échantillons indexés en mode double, par run. Cette technologie de
pointe répond à une demande croissante de la part de la recherche et des
laboratoires centralisés pour regrouper de plus grands nombres
d’échantillons par cycle d’instrument, permettant un séquençage plus
économique tout en assurant une meilleure précision des données.
Le séquençage ADN multiplexé est un flux de travail assez courant au
cours duquel plusieurs échantillons sont étiquetés et regroupés en un
seul run pour augmenter le débit et réduire le coût de séquençage par
échantillon. Plusieurs publications récentes évaluées par des pairs ont
montré que d’autres indices disponibles dans le commerce subissaient
l’impact d’erreurs de multiplexage, appelées « sauts d’indice » (index
hopping), l’assignation inadéquate du séquençage entraînant une lecture
du mauvais échantillon. En outre, les anciennes technologies de
séquençage ADN multiplexé sont sujettes à d’autres erreurs de
séquençage, ce qui aggrave les taux d’erreurs liés aux assignations
inadéquates. À mesure que la capacité des plateformes de séquençage
augmente, comme c’est le cas de la plateforme la plus récente
d’Illumina, NovaSeq™, la demande se fait de plus en plus pressante pour
des indices très rigoureux permettant de multiplexer un grand nombre
d’échantillons.
De l’avis des chercheurs chez Swift Biosciences, les Adaptateurs
Indexés Accel-NGS 2S constituent un ensemble de 96 indices uniques,
optimisés pour fonctionner en combinaison avec les adaptateurs P5 TruSeq®
d’Illumina afin d’obtenir jusqu’à 768 combinaisons uniques indexées de
manière double. Ces nouveaux indices sont optimisés pour offrir une plus
grande souplesse, et traiter entre 96 et 768 échantillons par run,
étiquetés de manière unique ; ils peuvent ainsi être adaptés à des
gammes de projets plus vastes avec une profondeur de séquençage
variable. En outre, la conception unique élimine les assignations
inadéquates et les sauts d’indices, un problème spécifique aux cellules
de flux à motif, d’Illumina. Ces améliorations offrent une plus grande
sensibilité qui permet de détecter les variantes de basse fréquence et
d’obtenir une plus grande fidélité pour accélérer le démultiplexage lors
de l’analyse des données.
« Notre objectif chez Swift est de donner aux scientifiques la
possibilité de générer des données de la plus haute qualité à partir de
n’importe quel type d’échantillon, leur permettant de repousser les
limites de leur domaine scientifique », a déclaré Timothy Harkins,
président et chef de la direction de Swift Biosciences. « Nos nouveaux
Adaptateurs Indexés Accel-NGS 2S éliminent les écarts en matière de
débit et de coût sur les plateformes Illumina, et combinés aux
technologies Accel-NGS 2S, ils vont permettre à tous les types de
laboratoires de séquençage de générer des données de meilleure qualité,
et ce, de manière beaucoup plus rentable. »
Première commande commerciale
Les nouveaux Adaptateurs Indexés Accel-NGS sont disponibles dans le
commerce dès maintenant. La première commande commerciale a été expédiée
à la société Shanghai Nanodigmbio Biotechnology Co. LTD, un partenaire
du réseau de distribution pour le portefeuille de produits de Swift en
Chine. Shanghai Nanodigmbio Biotechnology est l’un des marchés du
séquençage à la croissance la plus rapide, et un acteur crucial dans la
recherche sur la génomique et les maladies. En 2016, la Chine a dévoilé
son « Plan quinquennal » mettant l’accent de manière stratégique sur la
médecine de précision, un domaine d’intervention de la génomique, en
expansion rapide qui devrait guider l’avenir du diagnostic et du
développement thérapeutique.
« Les nouveaux Adaptateurs Indexés de Swift offrent un avantage majeur
aux chercheurs qui s’occupent du séquençage avec enrichissement de
cibles », a déclaré Chance Wu, PDG de la Shanghai Nanodigmbio
Biotechnology Company. « Désormais il sera possible pour les chercheurs
de maximiser le nombre d’exomes par run pour inspecter rapidement et de
manière plus rentable de plus grands ensembles d’échantillons. »
Le texte du communiqué issu d’une traduction ne doit d’aucune manière
être considéré comme officiel. La seule version du communiqué qui fasse
foi est celle du communiqué dans sa langue d’origine. La traduction
devra toujours être confrontée au texte source, qui fera jurisprudence.
Contacts
Lambert, Edwards & Associates
Darby Wagner, (616) 258-5779
dwagner@lambert-edwards.com